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1861年在德国出土 最早发现的一枚始祖鸟化石,是1861年在德国出土的,至今已经过去一百多年了.迄今已发现1个羽毛化石和7具始祖鸟化石标本,全都是在德国巴伐利亚地区的索伦霍芬附近的侏罗纪后期(距今约1亿5千万年)石灰岩地层中发现的.
1985年英国加的夫考古学院的鸟类古生物学家F?霍尔和古物理学家C?维克拉马辛却对始祖鸟化石提出疑义，认为始祖鸟化石是伪造的，只不过是在标准的爬行动物骨骼上，人为地配上美丽的装饰羽毛而已。以色列物理学家L?史培纳在伦敦自然博物馆的支持下，拍摄了化石标本的照片，并刊登在当时英国的《摄影月刊》上。照片上清楚地显示出羽毛上下模型的叠影和羽毛下的涂胶痕迹。说明伪造者是在普通爬行动物骨骼上粘上羽毛，并翻模制作成的“始祖鸟化石”。霍尔和维克拉马辛在取样并仔细检测了化石标本后又提出证据：化石标本上的一道裂缝是用工具人为敲击的结果；翅膀化石部分的枝叶晶体与其他部分的截然不同；况且，化石骨骼没有龙骨突和胸骨，说明此种动物根本不会飞翔，这就从根本上违反了始祖鸟的概念——一支古爬行动物为了适应飞翔生活，前肢转化为翼，鳞片演化成羽毛。
霍尔和维克拉马辛的观点引起了古生物界的一场激烈的争18款禁用软件APP入口WWW论。许多科学家对此表示赞同，伦敦自然博物馆的A?查利基先生说，他简直不相信过去的古生物学家何以把鸟类的进化描绘得如此栩栩如生，也许伪造者正是利用人们急于揭示鸟类进化的紧张心理来达到一鸣惊人乃至流芳百世的目的。
最近，收藏始祖鸟标本的英国伦敦自然博物馆两栖类、爬行类、鸟类馆馆长A?克利格及其同事们，正式撰文反驳了霍尔和维克拉马辛的观点。他们认为始祖鸟化石绝非赝品，其依据是：用显微镜观测，化石标本没有任何涂胶的痕迹；标本上的一道裂缝几乎成直线，人工不可能敲击出这种形状，这是最基本的概念；用紫外线摄影检测，整个化石与枝叶部分的晶体结构和分布是完全一致的。克利格等人说，世界上许多科学家已不再对始祖鸟的真实性持怀疑态度。
霍尔与维克拉马辛却不理会这些反驳论据，他们要求从化石标本上取样重新进行测定，但却遭到博物馆的拒绝。克利格说，除非他们自己发现了明显的可疑点，化石标本不再钻孔化验，并一概谢绝外借。
最后一件始祖鸟化石，也就是第十件始祖鸟化石，于2005年12月于《科学》杂志被具体描述，这件可能不比柏林标本逊色、且是第一具流入欧洲以外国家的始祖鸟化石，很快引起轰动。论文的作者梅尔与保尔，前者是德国法兰克福森肯堡自然史博物馆的鸟类学家。后者是美国一位兽医，也是化石的拥有人。保尔标本非常完整，其头部骨骼、前翼以及尾部羽毛的印痕清晰可见，它足以回答尚不清楚的一些问题。有趣的是，从骨骼的形态和组合特点来看，保尔标本更加接近恐爪龙类，这直接支持了鸟类起源于恐龙的假说。
骨骼
首先从头骨来看，保尔标本保存了迄今最完整的头骨，它整个头顶和右侧的颌骨全部暴露出来，可以看到完整的眶前孔，这与兽脚类的眶前孔是同源结构，意味着他们进化自同一个祖先，所以彼此间有相似的结构和功能。而保尔标本的鸟喙骨（肩胛骨、鸟喙骨与叉骨构成鸟类的肩带）形态与兽脚类中的驰龙类非常相似，而且鸟喙骨和肩胛骨也没有愈合。最有趣的是，从保尔标本保存完好的脚部可以看出，始祖鸟应该是地栖性的，它可能难以上树。我们知道，鸟类为了适应飞行，其后肢产生了很大的变化，其腓骨退化成刺状，跗骨的上部与胫骨合并成胫跗骨。通过这样的简化与胫跗骨的延长，鸟类大大增加了起飞和降落的弹性。此外，大多数鸟类具有4趾（第五趾退化），第一趾（拇指）向后，其他3趾向前，这个钳子一样的结构可以方便它们在树栖时握住树枝。以前，由于早期的始祖鸟标本都没有保存这些形态特征的细节，所以古生物学者都推测始祖鸟应该是在树上生活的。此时保尔标本告诉我们相反的答案：它的第一趾着生的第一拓骨位置靠前，并附着在第二拓骨的侧面，而第一趾骨还未扭转，这直接说明了始祖鸟还不具有第一趾与且他3趾对握的结构，证明它无法再树上生活。
地面奔跑的假设
既然无法在树上生活，那么始祖鸟就只能在地面奔跑了。保尔标本也给了我们其他栖性的证据：其第二趾延长，第二趾靠近上端的第一节关节极度膨大，都说明始祖鸟善于在地面奔跑，而且靠第二趾抓地而获取力量。这与恐爪龙非常类似。 当前，世界上只发现11例始祖鸟的化石，第十例化石表示始祖鸟属于恐爪龙下目，该下目也包含伶盗龙与恐爪龙。
这11例始祖鸟化石大都是在德国的巴伐利亚州的石灰岩层中发现的,距现今已有1.5亿年了，这些化石被证明为始祖鸟。这些化石上有清晰的羽毛印痕，而且分为初级和次级飞羽，还有尾羽。它的前肢特化成飞行的翅膀，后足有4个趾，都朝着前面，而不是今鸟的三前一后；锁骨愈合成叉骨，耻骨向后伸长。这些特征都与现代鸟类相似。但奇怪的是，它的嘴里长着牙齿，翅膀尖上长着三个指爪；掌骨和跖骨都是分离的，还有一条由许多节分离的尾椎骨构成的长尾巴，这些特点又和蜥形纲极为相似。经研究证明，它是蜥形纲向鸟类过渡的中间阶段的代表，故被称为“始祖鸟”。始祖鸟也许不能飞行，可能在内陆海岸边的地上追逐和捕捉昆虫和爬行动物。
那么类似于始祖鸟的近鸟类动物是怎样从地栖生活转变为飞翔生活的呢?关于这个问题，有两种说法。一种认为，盗龙之类的动物在树上攀缘，逐渐过渡到短距离滑翔，进一步变为飞翔。另一种认为，原始鸟类是双足奔跑动物，靠前肢网捕小型动物为食，前肢在助跑过程中发展成翅膀。
始祖鸟虽然仅仅发现在化石里，但它为鸟类起源于恐龙提供了证据。
随着热河生物群的发现，始祖鸟的分类地位遇到了挑战。
在热河生物群，许多有真羽毛甚至有完整羽翼的动物都被归入了恐龙类，而其中的某些种类比始祖鸟更接近鸟类另一些则比始祖鸟更原始。因为古生物种类是不许改名字的，故始祖鸟这个名称没有被触动，而它的分类地位，放在恐龙里才最合适。 最早的始祖鸟化石发现于1861年，地点是德国巴伐利亚州索伦霍芬印版石石灰岩地层中，当地原为采石场。该地石质较为细腻，因此化石保存完好，保留了清晰地羽毛印痕。该化石的首个研究者是梅伊尔，命名为印版石古翼鸟，始祖鸟为我国的通称。
1877年在距第一具化石发现地不远处发现了第二具化石。1884年古生物学家达姆斯研究了该化石。经测量计算发现该化石比1861年发现的化石小十分之一，但达姆斯认为这是由于化石个体差异造成的，两者属于同种。
1897年，达姆斯重新研究两具化石，根据两者的肠骨构造不同，认定第二件化石属于另一种，取种名“西门子古翼鸟”。1921年和1925年，皮特罗尼维克详细研究两件化石，列举了其15点差别，认定两化石属于两科，1861年发现的化石属于古翼鸟科，1877年发现的化石属于原鸟科，原鸟现今已被废除，因为它是不同动物化石的组合。
此后不断有人发表自己的见解，直到1幸福宝草莓丝瓜芭乐鸭脖大全954年，贝尔（Gavin de Beer)对化石详细研究，最终确认两件化石属于同属同种，仍以1861年梅伊尔的命名”印版石古翼鸟“为种名。经近100年的研究，学界至此确定了始祖鸟的分类。
1956年，距第一件化石产地250米处，第三件化石被发现。该标本缺失头骨，仅保留部分体骨和羽毛印痕。
1970年、1973年，两件原被认为是翼龙化石的标本被确定为始祖鸟。
1985年、1992年，第六件、第七件始祖鸟化石被发现。
之后又发现4块始祖鸟化石，最著名的是第十件，叫作“保尔标本”。
现今，首件化石保存于英国伦敦，1877年发现的化石保存于柏林博物馆。
1861年，在德国最西南部的巴伐利亚省境内索伦霍芬小镇附近的一个海相沉积印板石石灰岩矿坑里，在深约20米的石灰岩内，工人采集到一块形态非常奇异的化石，从形体看它很像一条小恐龙。但是，在这块脊椎动物化石的前肢和尾巴的两侧，却保存有十分清楚的羽毛印痕。这块特殊的化石辗转送到英国自然博物馆。生物学家迈耶在给朋友的一封信中宣布了他研究鉴定的结果。他认为这是世界上第一次发现的最原始的鸟类化石，并为之命名为印板始祖鸟，意思是从海相沉积的石类印板石内发现的原始鸟类。迈耶的信先后在德国的矿物、地质和古生物新年鉴上发表，引起了人们的极大关注。它的发现给刚刚发表不久的达尔文的进化论以无可辩驳的支持。
从始祖鸟的化石中可以发现的生命遗迹：
最早生命的证据目前所知的世界上最古老的岩石位于澳大利亚。而最古老的化石是
35亿年前的细菌群落叠层石，第一个脊椎动物早期脊椎动物的化石记录十分参差不齐。最早的脊椎动物几乎没有矿化的骨头，因此没有太多坚硬的部分可以形成化石并保存下来。
1861年8月，德国古生物学家冯迈耶宣布在该处地层中发现了一个羽毛化石。人们还来不及对这个消息做出反应，一个多月后，冯迈耶又宣布在同一个地方发现了一具较为完整(缺少头部)的化石标本，这具化石标本清楚地显示出这种古生物有一对长着羽毛的翅膀，冯迈耶将之命名为“ArchaeopteryxLithographica”，意思是“长着古翼的印版石”，中文意译为“始祖鸟”。
出土这具始祖鸟化石的采石场的主人把这块化石作为治病的报酬给了当地的医生、化石收藏者卡尔?哈伯伦。后来，哈伯伦为了给女儿办嫁妆，向外界表示愿意出售该标本。大英博物馆自然历史部的负责人理查德?欧文是当时公认的古生物学权威，也是达尔文进化论的主要反对者，他把始祖鸟化石视为一大威胁，决心不惜任何代价将它买来控制在自己手中，由他本人来做权威鉴定。1862年10月1日始祖鸟化石抵达大英博物馆，以后一直留在那里，被称为“伦敦标本”。
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